Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCB1

Ndc1, Nucleoporin NDC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc1Q8VCB1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc1Q8VCB1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndc1Q8VCB1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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