Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clptm1Q8VBZ3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clptm1Q8VBZ3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clptm1Q8VBZ3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms