Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc137Q8R0K4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc137Q8R0K4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms