Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b4Q8QZY9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms