Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N3

Vmn1r189, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r189Q8K3N3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r189Q8K3N3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r189Q8K3N3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r189Q8K3N3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r189Q8K3N3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r189Q8K3N3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r189Q8K3N3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r189Q8K3N3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Vmn1r189Q8K3N3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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