Protein–RNA interactions for Protein: Q8K349

Gimap6, GTPase IMAP family member 6, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimap6Q8K349 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Gimap6Q8K349 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Gimap6Q8K349 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Gimap6Q8K349 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Gimap6Q8K349 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Gimap6Q8K349 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Gimap6Q8K349 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gimap6Q8K349 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms