Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ssh3Q8K330 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ssh3Q8K330 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ssh3Q8K330 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssh3Q8K330 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ssh3Q8K330 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ssh3Q8K330 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ssh3Q8K330 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ssh3Q8K330 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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