Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Neil3Q8K203 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms