Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS7

Hmgcll1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcll1Q8JZS7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgcll1Q8JZS7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms