Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc4a8Q8JZR6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms