Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Znf628Q8CJ78 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf628Q8CJ78 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Znf628Q8CJ78 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Znf628Q8CJ78 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf628Q8CJ78 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Znf628Q8CJ78 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf628Q8CJ78 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf628Q8CJ78 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf628Q8CJ78 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Znf628Q8CJ78 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms