Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms