Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnl3Q8CGK6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnl3Q8CGK6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms