Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup88Q8CEC0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms