Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms