Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcinQ8CDE2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms