Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl3Q8CD19 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms