Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms