Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssuh2Q8C3L1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssuh2Q8C3L1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms