Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ska3Q8C263 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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