Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C1R3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C1R3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms