Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q2

Zhx3, Zinc fingers and homeoboxes protein 3, mousemouse

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Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zhx3Q8C0Q2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Zhx3Q8C0Q2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Zhx3Q8C0Q2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Zhx3Q8C0Q2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zhx3Q8C0Q2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zhx3Q8C0Q2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zhx3Q8C0Q2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Zhx3Q8C0Q2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms