Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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