Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Snx16Q8C080 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Snx16Q8C080 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Snx16Q8C080 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Snx16Q8C080 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Snx16Q8C080 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Snx16Q8C080 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Snx16Q8C080 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Snx16Q8C080 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Snx16Q8C080 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Snx16Q8C080 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Snx16Q8C080 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms