Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp47Q8BY87 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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