Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsfm13Q8BXS2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms