Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm4aQ8BW72 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm4aQ8BW72 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms