Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Pggt1bQ8BUY9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Pggt1bQ8BUY9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Pggt1bQ8BUY9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms