Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms