Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik4Q8BMF5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik4Q8BMF5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms