Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcal1Q8BJL0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms