Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms