Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms