Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Necab1Q8BG18 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms