Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M10.2Q85ZW9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms