Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Liat1Q810M6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Liat1Q810M6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms