Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem39bQ810L4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem39bQ810L4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms