Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo1Q80ZD8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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