Protein–RNA interactions for Protein: Q80YF6

Upk3b, Uroplakin-3b, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bQ80YF6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk3bQ80YF6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk3bQ80YF6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk3bQ80YF6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk3bQ80YF6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk3bQ80YF6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk3bQ80YF6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk3bQ80YF6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk3bQ80YF6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk3bQ80YF6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk3bQ80YF6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Upk3bQ80YF6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3bQ80YF6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms