Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh8Q80Y20 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh8Q80Y20 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms