Protein–RNA interactions for Protein: Q80V62

Fancd2, Fanconi anemia group D2 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fancd2Q80V62 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fancd2Q80V62 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fancd2Q80V62 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fancd2Q80V62 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fancd2Q80V62 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fancd2Q80V62 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms