Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rpp38Q80UU2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rpp38Q80UU2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpp38Q80UU2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpp38Q80UU2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpp38Q80UU2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpp38Q80UU2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpp38Q80UU2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpp38Q80UU2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms