Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Sgo2Q7TSY8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Sgo2Q7TSY8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms