Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms