Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LnpkQ7TQ95 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms