Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrc2bQ7TPM1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms