Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Scn4bQ7M729 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Scn4bQ7M729 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Scn4bQ7M729 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Scn4bQ7M729 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Scn4bQ7M729 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Scn4bQ7M729 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Scn4bQ7M729 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Scn4bQ7M729 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn4bQ7M729 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Scn4bQ7M729 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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