Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms