Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TwistnbQ78WZ7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms