Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Sys1Q78S06 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Sys1Q78S06 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Sys1Q78S06 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Sys1Q78S06 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Sys1Q78S06 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Sys1Q78S06 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Sys1Q78S06 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sys1Q78S06 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sys1Q78S06 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sys1Q78S06 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sys1Q78S06 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Sys1Q78S06 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Sys1Q78S06 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Sys1Q78S06 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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